STIE Indonesia Banjarmasin memiliki 3 (tiga) program studi  yaitu S1 Ilmu Ekonomi Manajemen dan Ilmu Ekonomi Akuntansi S1 dan D3 Akuntansi serta Program Strata dua Magister Manajemen  Program studi tersebut menyelenggarakan proses belajar mengajar sesuai dengan bidang ilmu masing-masing dan melaksanakan pengkajian kurikulum, terutama yang berkaitan dengan bidang akademik, serta melaksanakan evaluasi kegiatan akademik baik yang dilaksanakan oleh dosen maupun mahasiswa.

Program Magister Manajemen

Guna mewujudkan cita-cita pembangunan nasional yaitu tercapainya masyarakat adil dan makmur dan sekaligus ikut berperan dalam menciptakan manajer tangguh, profesional dan tenaga edukatif, mulai tahun akademik 2009/2010 STIEI Banjarmasin akan menyelenggarakan Program Pascasarjana untuk kategori pendidikan S-2 dalam Program Magister Manajemen.

Adapun tujuan diselenggarakannya Program Magister Manajemen STIE Indonesia adalah:
   1. Mendidik Sarjana S-1 yang ingin meningkatkan jenjang kariernya sebagai       manajer profesional.
   2. Mendidik tenaga edukatif yang berpendidikan  S-l untuk meningkatkan kualifikasi ke jenjang magister (S-2) yang mempunyai kedalaman serta keluasan dalam teori dan kemampuan analisis yang komprehensif.

 
Program S1

    * Program S1 Jurusan Manajemen ditawarkan bagi calon peserta didik yang berminat mendalami bidang ilmu manajemen khususnya bidang keuangan dan perbankan, bidang sumber daya manusia dan bidang pemasaran serta bagi yang bercita-cita menjadi manajer profesional.
    * Program  S1 Jurusan Akuntansi ditawarkan bagi calon peserta didik yang berminat mendalami bidang ilmu akuntansi dan bagi yang berkeinginan menempuh karier profesi akuntan. 

 
Program D3

Program D-3 Akuntansi disediakan bagi calon perserta didik yang berminat menempuh karier profesi Akuntan pada level ahli madya.